2016年11月24-27日在合肥召开了中华医学会病理学分会第二十二次学术会议暨第六届中国病理年会。本次大会有国内外知名的病理专家就学科领域的最新研究热点、前沿问题做精彩报告，同时也有大会发言、壁报等各种交流形式。
思路迪在本次大会期间特地举办以NGS在分子病理中的应用为主题的卫星会，邀请了全国各地多名病理科专家进行精彩报告与专题讨论，内容丰富翔实，吸引了参会医生和嘉宾的热烈关注。同时，思路迪还举行AB meeting，邀请权威专家一起探讨思路迪与医院合作及搭建分子病理学科平台经验分享。
思路迪卫星会由南方医科大学基础医学院病理学系／南方医院病理科主任，广东省分子中国肿瘤病理实验室主任丁彦青教授，中山大学肿瘤防治中心分子诊断科主任邵建永教授共同担任主席。在卫星会的报告中，几位嘉宾分别就如何建立用于分子病理诊断的NGS平台，NGS数据注释在遗传性肿瘤中的实践，以及肿瘤免疫微环境的病理评价等主题发表精彩演讲。
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会议主席 丁彦青 教授（南方医科大学基础医学院病理学系／南方医院病理科主任，广东省分子中国肿瘤病理实验室主任）
思路迪精准医疗研发副总裁李福根博士从实体瘤、液体活检、检验实验室的内部质控和外部质评等多角度分析如何建立符合临床检测要求的NGS平台。李福根博士谈到，NGS测序技术发展已有多年，但是由于多基因检测涉及SNV/Indel，CNV等多种突变类型、突变频率和分布也存在较大差异，为了保证准确性，用于诊断目的的NGS检测平台必需经过严格验证。思路迪已建立了一系列商业化肿瘤细胞系，作为中国唯一拥有自主标准参考品的公司，思路迪的NGS平台采用体外DNA、肿瘤细胞系和组织FFPE样本的三重验证，结果表明组织样本的肿瘤细胞含量达到20%，测序深度达到500X才能够确保NGS检测用于临床诊断的灵敏度和特异性。基于严谨的科学验证结果，思路迪受邀参与吴一龙教授牵头、中国临床肿瘤学会（CSCO）和中国肿瘤驱动基因分析联盟 （CAGC）联合制定的二代测序（NGS）技术应用于临床肿瘤精准医学诊断的共识，并且在最终颁布的共识关键技术参数上有所贡献。接着，李福根博士介绍了思路迪液体活检平台的技术及验证情况。由于常规NGS检测不能达到液体活检的灵敏度要求，思路迪采用新的建库技术，在测序前为每个ctDNA片段增加了特异性的分子标签，同时通过生物信息算法优化，高效降噪，提高低丰度变异的检出率。由于在测序和数据分析环节的独特优势，思路迪的ctDNA测序在提高测序深度的同时大大增加有效数据量，平均有效检测深度在5000X左右，检测下限达到万分之三，可以比传统的ctDNA检测方法多检测出28%的变异。经过肺腺癌临床样本验证，思路迪采用了全新ctDNA测序方法的液体活检平台在灵敏度各项指标上可与国际一流液体活检公司Grail和Guardant360相媲美。除了技术方面的验证，李福根博士还介绍了思路迪NGS平台如何通过严格的内外部质量管理体系保障检测结果的准确性，满足临床应用标准。今年以来，思路迪已连续六次通过国内外机构组织的基因检测室间质评，包括此次病理大会上刚颁布证书的国家卫计委PQCC分子病理室间质评，以及此前获得的国家卫计委ctDNA基因突变检测室间质评，上海市临检中心和美国病理协会CAP组织的能力验证。
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李福根 博士（思路迪精准医疗研发副总裁）
目前，人们在精准医疗实践中越发认识到数据注释和解读的重要性。此次会议上，来自中山大学肿瘤防治中心分子诊断科主任邵建永教授结合遗传性肿瘤方面的临床经验，分享了对NGS数据注释和解读的经验及看法。肿瘤基因变异注释需要对变异的复杂性和相应的数据分析有深刻理解，对于点突变、基因重排／融合、插入和缺失、拷贝数变化等不同的变异类型要设计有针对性的测序方法，并开发不同的算法进行生物信息分析。美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）指南提供了遗传病致病基因变异注释的标准和依据。报告中，邵建永教授分享了和思路迪公司合作的针对遗传性肠癌家族患者的NGS数据注释，说明规范化的注释流程结合人工判读有助于发现更多新的信息。该项针对600多例肠癌易感基因的初步数据分析结果显示中国人的MSH6，PMS2基因变异类型与西方人群具有明显差异，意义未明的变异（VOUS）比例很高，通过结合人工注释，进一步发现若干可能是中国人特有的致病突变，目前正在采用功能实验验证。邵建永教授总结认为，数据分析是NGS最复杂，最困难，也是最有意义的部分，然而目前很多二代测序公司对基因变异的注释只是参照国际公共数据库进行简单的机械化操作，很容易带来注释的错误。他强调：真正是数据注释绝不是工业化、流程化的电脑注释，而应该是人工注释；我们应该客观看待NGS技术的优势和不足，努力将NGS数据与遗传信息、临床信息结合起来，从肿瘤治疗和遗传风险评估两方面去干预，这才是NGS应用最合理化的选择。
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会议主席 邵建永 教授（中山大学肿瘤防治中心分子诊断科主任）
目前，免疫治疗是肿瘤研究的热点，由肿瘤细胞、免疫细胞、免疫细胞表面的受体及配体、细胞因子、趋化因子构成的肿瘤免疫微环境（TME）与肿瘤的发生发展密切相关。此次思路迪卫星会还邀请到北京医院病理科王征教授带来“肿瘤免疫微环境的病理评价”的精彩报告。病理分析的重要目的就是为肿瘤预后提供有价值的信息。王征教授在报告中介绍了与肿瘤预后相关的免疫微环境病理评价——免疫评分（Immunoscore）。免疫评分由法国Galon教授提出，通过肿瘤和浸润区域的CD8+和CD3+等免疫组化标记物检测，并结合肿瘤TNM分级进行预后评分。Galon免疫评分系统在临床应用中证实为有强烈提示预后价值的指标。肿瘤微环境的病理评价，包括组织学改变评价及免疫组化免疫细胞分类的评价，有望成为不同瘤种国际指南推荐的评价预后指标。值得注意的是，Galon免疫评分在使用过程中要保证流程及试剂的标准化，数字病理及图像分析技术应用是肿瘤免疫评分是增加评分客观性及可重复性的关键。
接下来，王征教授讲到了免疫检查点治疗相关病理评价。PD-L1的阳性状态与免疫检查点治疗的疗效相关。目前不同临床研究所用的PD-L1检测抗体及检测平台、判读标准均存在较大差异，给临床检测带来很大的困惑，减低了检测结果的一致性和重复性。因此，寻找对免疫治疗特定的生物标志物非常关键，比如错配修复基因（MMR）和突变负荷（mutation burden）。研究证实MMR和mutation burden可以预测免疫检查点治疗的疗效，MRD的患者也更容易出现高突变负荷，对免疫检查点抑制剂效果显著。
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王征 教授（北京医院病理科）
为了让更多的病理医生参与临床实践大讨论，本次卫星会还设置讨论环节，邀请到中山大学肿瘤防治中心分子诊断主任邵建永，北京医院病理科王征，湖北省肿瘤医院病理科主任邓云特，深圳市第二人民医院病理科副主任关弘，武汉大学中南医院病理科主任杨桂芳等分子病理领域专家共同参加，就“液体活检or组织活检”的临床决策发表看法，台下观众也热情参与讨论。专家普遍认为应该根据临床目的选择检测方法，诊断为目的应以组织检测为主；靶向治疗耐药，实时监控为目的可以选液体活检。在目前的技术条件下，液体活检适合作为组织活检的有效补充。针对另一个话题“单基因检测or多基因检测”，专家认为一是要遵循临床意义。肺癌多基因检测已得到共识，但是有些癌症做多基因检测临床获益不明显。二是要考虑患者需求。可以先做临床需求最明确的单基因，条件许可再做多基因。除了费用因素，多基因检测还涉及数据分析和报告解读的复杂性，应该选择经过严格验证的NGS平台进行多基因检测和临床注释。
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会议讨论环节（邵建永，王征，邓云特，关弘，杨桂芳，李福根）
